样品前处理室主要包含无机、有机样品的前处理室，试剂室等三部分。可以实现海水、沉积物、生物体中666、DDT、多氯联苯等有机物的提取，浓缩等功能，同时实现化学需氧量，溶解氧、硫化物、有机碳的测定和叶绿素、营养盐、重金属的前处理等功能。

主要仪器有：全自动固相萃取仪、快速溶剂萃取仪、平行浓缩仪、全自动蒸馏仪、石墨加热板、纯水机、油浴锅、水浴锅、酸纯化器、旋转蒸发仪、离心机等。